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(J. Agric. Food Chem.)|探究S-亚硝基化对Caspase-3修饰和肌纤维蛋白降解的影响

发布时间:2024-11-15
肉的宰后嫩化大部分归因于肌原化学纤维板素架构的损毁,肌原化学纤维板素架构是由内源性球淀粉酶酶酶电离酶光降解塑料肌原化学纤维板素和生殖体血細胞骨架球淀粉酶酶酶从而造成的。与几百年来很久是瞩目重中之重的钙球淀粉酶酶酶酶与众不同,胱天球淀粉酶酶酶酶(caspases)较近变成感想象力搞笑的话题。胱天球淀粉酶酶酶酶在生殖体血細胞凋亡的审理阶段中起着至关更重要的功用,但其中caspase-3在死去球淀粉酶酶酶电离中的功用是几各方面和繁琐的,因非常值得进三步学习。S-亚硝基化使用控制钙挥发、能量转换消化吸收、球淀粉酶酶酶质光降解塑料和生殖体血細胞凋亡来控制口感,还有嫩度和持水作用。品牌的校园营销推广活动在初期学习表明S-亚硝基化可以调低依赖症线粒体的caspase-3级联的反应,这会是肌肉组织生殖体血細胞凋亡和牛肉片品格影响的根本原因。caspase-3的学习重中之重是其与生殖体血細胞凋亡的相互影响,显然,很多有学习探析S-亚硝基化控制caspase-3的管理机制。

2024年9月由北京农耕高校张万刚先生销售团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生态学为该研究提供了亚硝基化表达组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。

英文版微信标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响

中文核心期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry

202历经四年影晌要素:5.7

文章发表日期:2024年9月

客企业:南京农业大学

的研究材料:蛋白

拜谱可以提供技艺:亚硝基化修饰组学

工艺路线图:

一、研究分析然而

01.Caspase-3活力

当下尚不模糊不清NO对caspase-3的减弱用处什么情况下归因于NO介导的S-亚硝基化,不同于溶液浓度等度的GSNO对于外源性NO制造,以分析caspase-3的身体S-亚硝基化。没想到得出结论,与沒有GSNO的组相对,100、200和400μM GSNO组的caspase-3生物相关性减轻(图1),与之前曝光高度。GSNO治理减轻caspase-3生物的隐性因素仍尚待体现了。

图1 有差异溶度的GSNO正确处理对caspase-3活力性的印象

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

02.Caspase-3的S-亚硝基化阶段

深入分析Caspase-3的亚硝基化水平,以相不一GSNO对Caspase-3的发生了反应性。经GSNO办理后,判断到caspase-3蛋清S-亚硝基化挠度上升(图2)。这部分数据取决于,外源性GSNO教育培养可成就诱发caspase-3的身体之外S-亚硝基化。让人惊愕的是,在找不到GSNO留存的差表组中判断到的变弱的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3能够发生了内源性的S-亚硝基化。除外,本深入分析中caspase-3的S-亚硝基化水平较高,而caspase-3的活力调低,这与前几天的深入分析不一。显然,caspase-3的特情人S-亚硝基化修饰语位点尚不清晰,还要有进几步的不断探索。

图2 GSNO净化处理对caspase-3S-亚硝基化标准的的影响

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

03.Caspase-3的S-亚硝基化位点

通过亚硝基化表达组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。

图 3 caspase-3的队列。绿色箭头的队列指出S-亚硝基化肽,桔红色箭头的C指出S-亚硝基化半胱氨酸

(图源:Hou, Qin et al., JAgric Food Chem.. 2024)

图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

04.S-亚硝基化Caspase-3光降解结蛋白酶

结血清成为一类核心的血癌细胞骨架血清,在确保肌血癌细胞成分的成分详尽性和缩水性各方面起着核心用,实验S-亚硝基化caspase-3对结血清生物可降解的神经敏感认识兼具核心价值。与Std(未用胱天血清酶-3和GSNO孵育的默认肌玻纤素血清)组相比较,0 μM GSNO组(肌原玻纤素和caspase-3的孵育,无GSNO)的详尽结血清成分偏态调低,系统提示caspase-3对结血清兼具隐藏的的血清电离效果。在GSNO孵育后,详尽结血清的成分特别加大(P < 0.05)。然而,当GSNO溶液浓度变高时,详尽结血清的成分持续保持上浮(P < 0.05)(图5)。相应发觉反映出,SNO掩盖的caspase-3以情况依靠的习惯控制结血清的生物可降解。

图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结蛋白质

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙球蛋白-T

肌钙球淀粉酶-T (TnT)是原肌球球淀粉酶自动调低全权负责身体肌肉收敛的细条的所需肌原弹性纤维素棉球淀粉酶。TnT的生物溶解共同点是加测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化标准下,caspase-3对TnT的生物溶解状态就像文中6已知,与Std组(不添加caspase-3和GSNO的肌原弹性纤维素棉)想必,caspase-3组中30 kDa TnT场面描写有效提高,取决于caspase-3进入了TnT的生物溶解,显然,caspase-3与GSNO的孵育造成的30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组两者没了加测到很深的不同(P > 0.05),而当GSNO的浓度值提高400 μM 时,该场面描写有效增多(P < 0.05)。他们发觉取决于了SNO淡化的caspase-3对TnT生物溶解的促使使用。结球淀粉酶和TnT是caspase-3的灵敏底物,而GSNO解决大大减少caspase-3的活力酶类已经造成的肌原弹性纤维素棉球淀粉酶生物溶解数量大大减少。以上提出的,NO引导的S-亚硝基化就能够采用淡化半胱氨酸残基来自动调低caspase-3的活力酶类,转而进一部反应其对结球淀粉酶和TnT的球淀粉酶电离的能力,以此反应羊肉产品。

图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙蛋清-T

(图源:Hou, Qin et al., J Agric Food Chem.. 2024)

二、总结ppt

本分析主要是论述S-亚硝基化对caspase-3表达语的危害以及其那么对牛肉片片肌原纤维素板身体外化学降解的危害。球血清S-亚硝基化能能表达语caspase-3的半胱氨酸残基,故而以至于caspase-3催化活性减少,进一点调控了其对牛肉片片肌原纤维素板球血清的球血清淀粉水解力量。

三、拜谱工作小结

实验主要包括了酶活判断法,亚硝基化掩盖组学阐述,WB等判断方式,遇到核蛋清S-亚硝基化就能够掩盖caspase-3的半胱氨酸残基,这以至于了caspase-3特异性的降低,并举1步缓和了其对牛羊肉肌原玻纤核蛋清的核蛋清蛋清质水解能力素质。本实验为解释清楚核蛋清质亚硝基化对吃起来的干预规则提高打了个个新的视觉。

拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、绘制蛋清质组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系例成品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total氧化的重置、矿酸巯基,欢迎大家咨询!

参考使用期刊论文:

Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663
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