
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT核蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探析但是
研究探讨拜谱生物来探寻随之食品保鲜冷库准确耗时延后羊肉的坚硬程度、持水、油润度、解离于铁浓度、ROS、脂质过氧化的物、MDA、GSH和GPX4技术水平来考评力量组织机构肿瘤肿瘤细胞的铁死掉环境。的结果展示,食品保鲜冷库准确耗时延后后,羊肉的坚硬程度在第3天和第6天强势性减低;持水特性减轻;的颜色变深,失却油润,鲜桔大红色化为暗桔大红色。不仅,解离于铁、可溶性氧和MDA的浓度强势性加大,肿瘤肿瘤细胞凋亡率强势性身高。 探析人群提炼各种区别冷冻时刻的手臂肩部肌肉检样的脂肪酸质,之后做出SDS-PAGE定性剖析,脂肪酸质条带在各种区别时候分散饱满且相类似性(图1a)。据脂肪酸在各种区别检样中的表达方法情况报告,定性剖析找到同样一组检样的中六位数取决于于同样一品质(图1b),详细说明手臂肩部肌肉检样脂肪酸质具顺畅的组内相类似性性和组间距离性。 蛋清质组学共判定出1996种蛋清质。以B0为比对组,需求B1、B2、B4和B6中的蛋清完成性别文化差异理解定性研究,共判定到37九个DEPs。将火山图可视化研究,并多种FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.052标准定性研究DEP。结杲就像文中1c-f右图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别判定出22、33、73和140个DEPs,进来分刘海别上涨6、11、32和8九个,上涨16、22、41和52。聚类分析方式监测了多种冷冻箱关键期腹肌策划 中蛋清质的理解,结杲出现腹肌蛋清理解性别文化差异跟随永久保存用时的增高而增高(图1g)。
图1| 差异保鲜冷库耗时的肌肤打样定制核蛋白质含量组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不同速冻时间段的肩部肌肉原材料不同之处核蛋白深入分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身故蛋清肽的PRM定量研究分析研究分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 对于KEGG生物富集一定的差异表明蛋白质的铁身故长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT按量血清酶质组学方法售后服务性,拜谱菌物已研究开发完成任务并建设了进一步完善成孰的转录组学、血清酶组学、产生组学已经几组学合拜谱生物牌方法售后服务性采集体系,欢迎致电咨询!
参考选取文献资料:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.